Vivienda habitual + matrimonio

Adquirí una vivienda como propietaria única en la que me bonifiqué del pago del impuesto por ser joven, por lo que no "puedo venderla" porque debe constar 3 años como mi vivienda habitual.
En diciembre me caso, pero de la misma persona en la que me divorcié hace año y además vamos a tener un bebé (al ser la misma persona no se si verían como un "fraude" agarrarme a la excepción de no cumplir los 3 años en mi vivienda por casamiento) por lo que mi intención es seguir empadronada en mi vivienda habitual hasta cumplir esos 3 años, pero mi futuro marido tiene otra vivienda de su propiedad única en la que está empadronado (que además yo estuve ya empadronada hace 2 años atrás y le desgrava en la Renta (o eso creemos porque es VPO de hace más de 10 años)), tanto la mía como la suya es en el mismo municipio de Barcelona.
Mi pregunta es, podemos casarnos y seguir cada uno empadronado en una vivienda diferente? O cuando realice la declaración de la renta Hacienda verá raro y reclamará declarar el matrimonio en diferentes viviendas? O Él debería empadronarse en mi vivienda y no desgravarse su hipoteca (pero nos da miedo que luego le toque pagar muchísimo en su Renta)?
No contemplo la opción de pagar el resto de bonificación, puesto que al cumplir los 3 años quiero vender mi piso y no puedo tener ese gasto "extra" ahora mismo.

Me gustaría tener muy claro qué debemos hacer antes de casarnos, para hacerlo correctamente