Abrir ventanas en medianeras de 2 casas propias

Buenas tardes, tenemos unas dudas que nadie sabe aclararnos, ni tampoco queremos despertar mucha atención en nuestra población por este tema(por si acaso) queremos asesorarnos bien antes de hablar
El tema es que en Marzo compramos 2 casas contiguas, una para reformar con 67m de solar por planta, y la otra con 55m de solar, esquinera, la cual se destina a derribo y posterior patio( es lo único que me dejan hacer desde el ayuntamiento puesto que no cumple metros mínimos(porque tiene retiro según plan urbanistico) y se quedan 45m útiles de solar.
El caso es que hemos utilizado la casa de la reforma para abrir ventanas en la medianera hacia el patio(de mi propiedad) y el ayuntamiento en su día nos dijo que no se podía.
De hecho nos han abierto un expediente por abrir un hueco en la planta baja para poder trabajar cómodamente entre las dos casas y nos obligan a cerrarlas o nos paran la obra. Todo esto alegando ellos que estamos ampliando la casa destinada a la reforma, cuando no es cierto( abriendo hueco siguen siendo los mismos metros de solar en cada uno de ellos no?
La pregunta es fácil, hay alguna manera de justificar que abrimos ventanas a mi propiedad y que no me metan en líos con denuncias y posiblemente cerrarlas??
Alguna ley donde poder acogernos en caso de que actúen de oficio?
El arquitecto quiere pedir el final de obra y luego ya es responsabilidad nuestra abrir huecos.
En el art. 546 dice qie siendo los mismos propietarios se extinguen las servidumbres y tampoco tenemos claro que la casa esquinera(que sirve de patio, tuviera medianera ya que en las fotos del derribo solo se aprecian pilares y la pared de la otra casa.

Gracias