Si el padre no quiere que su hijo estudie religión y su madre si, ¿qué pasa?

Buenas tardes Don Luis. Bienvenido al complejo mundo de las relaciones humanas.
En respuesta a su consulta: la decisión ES DE LOS DOS. Le explico:
La sentencia o convenio en el que se otorga la custodia de un menor a uno de los progenitores se refiere a que convivirá habitualmente con uno de los progenitores, y que se relacionará con el otro de una forma y en unos tiempos concretos. Sin embargo, el poder de decisión sobre las cuestiones que afecten a los menores, los derechos y deberes de los progenitores hacia los hijos no forman parte de la custodia sino que conforman la PATRIA POTESTAD, y ésta es de titularidad y ejercicio conjunto de los dos progenitores.

La custodia NO ES un STATUS DE PRIVILEGIO de un progenitor frente al otro. La custodia se refiere a la convivencia y no implica titularidad de ningún otro derecho.

Así las cosas, de no haber acuerdo como usted indica, se debe acudir al juez. Este llamará a los progenitores y oídos estos escuchará la opinión del menor si tuviera discernimiento justo, para tomar la decisión vinculante.

Espero que le haya ayudado.
Un cordial saludo.