No me admiten los papeles del paro

Hola, en diciembre me despidieron de mi empresa que trabajaba por cuenta ajena y al ir a presentar los papeles del paro no me los admitieron porque estoy dado de alta como autónomo como administrador, único de una empresa y mi baja como autónomo es posterior a mi despido como trabajador por cuenta ajena, ¿qué puedo hacer para no perder el paro? Además por ese problema se me pasé el plazo de presentación.